剧情关卡系统是游戏中的主要玩法和内容。

玩家在不同的级别可以进入的关卡是有区别的，级别越高，可进入的关卡也就越高。再进入下一个关卡前，则先需要通关前一个关卡。

笑傲江湖中，玩家可以通过自行组队进入关卡，也可以通过匹配队友功能让系统自动为你匹配到合适的队友一起通关。匹配也是玩家认识新朋友的好机会。

而扫荡关卡则是为了帮助一些时间不充裕的玩家快速通关副本、获得奖励的功能。玩家只要通关了该关卡后，即可使用扫荡关卡功能。在扫荡关卡的过程中，玩家可以不用进行操作，甚至无需在线，是以逸待劳的上上之选。

玩家进行剧情关卡时，首先会通过场动画中的人物对话来了解故事情节，从而产生观看电影一样的代入感和沉浸感，从而在体验爽快打斗的同时也了解到整个故事的来龙去脉。某些关键剧情甚至可以通过玩家的行为选择造成一些和原著不一样的情节展开。

玩家通关后，会根据战斗的过程进行汇总而获得一个综合评价，从而获得人物经验、功力等，还能开启关卡宝箱。宝箱中可以收获一份惊喜。